ბოლო შეკვეთა იწყება მაშინ, როდესაც Desty Nova- ს ნანოტექნოლოგია ალიტას აცოცხლებს მცურავ ქალაქ ტიფარეში. ქალაქის შავი საიდუმლოებები სასტიკად არის გამჟღავნებული, მაგრამ, როგორც ჩანს, ეს სამყაროს რთული ნაწილია. მიდის კოსმოსში ძველ და ახალ კომპანიებთან ერთად, რომ უფრო მეტი გაიგოს მისი დავიწყებული წარსულის შესახებ და თანაბრად, მოძებნოს დაკარგული პავლე ლუ კოლინზი, ალიტა კოლონიზირებული მზის სისტემის მთავარ ძალებს შორის იმყოფება. გზად ის ალიანსს აფორმებს ალიტას სამ რეპლიკასთან, რომლებმაც ახლა უკვე დაიწყეს საკუთარი თავის რწმენა, უსიამოვნო სუპერჰაკერი და თავად ნოვა, როდესაც იგი Zenith of Things Tournament– ში (ZOTT) შევა, საბრძოლო შეჯიბრი, რომელიც ტარდება ყოველ 10 წელიწადში ერთხელ. დედამიწის კატაკლიზმული ზემოქმედების ზამთრის ჩათვლით, რამაც საზოგადოების დიდი ნაწილი მოაშორა მთელ თხრობაში, ნაჩვენებია უფრო მეტი ისტორია Battle Angel Alita– ს შექმნის შესახებ, რომელიც არ იყო ცნობილი ადრეულ სტრიქონში.
